MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 33561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003552	GCT	2	6	175482	175487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_003552	AAT	2	6	175557	175562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_003552	TTCT	2	8	175578	175585	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_003552	T	6	6	175604	175609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_003552	TATT	2	8	175620	175627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_003552	AGG	2	6	175629	175634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_003552	AAT	2	6	176295	176300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_003552	GGA	2	6	176333	176338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_003552	AAGT	2	8	177105	177112	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_003552	ATG	2	6	177153	177158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_003552	GA	3	6	178492	178497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_003552	A	7	7	178591	178597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_003552	TTTA	2	8	178623	178630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_003552	A	7	7	178666	178672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_003552	AAT	2	6	178716	178721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_003552	TA	3	6	178729	178734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_003552	AAT	2	6	178768	178773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_003552	CT	3	6	180529	180534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_003552	TTC	2	6	180548	180553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_003552	GA	3	6	180567	180572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_003552	GAA	2	6	180614	180619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_003552	CGG	2	6	180675	180680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_003552	AAC	2	6	180706	180711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_003552	GGA	2	6	180792	180797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_003552	A	6	6	180981	180986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_003552	A	6	6	181065	181070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_003552	AT	3	6	181107	181112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_003552	GA	4	8	181137	181144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_003552	ATGC	2	8	181274	181281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1031	NC_003552	TAT	2	6	181313	181318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_003552	ACTTA	2	10	182448	182457	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1033	NC_003552	ACA	2	6	182477	182482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_003552	CA	3	6	182489	182494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_003552	CAGA	2	8	182514	182521	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_003552	CTT	2	6	182598	182603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_003552	AAT	2	6	182662	182667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_003552	T	8	8	182679	182686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_003552	TAA	2	6	182732	182737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_003552	ATT	2	6	182751	182756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_003552	CTT	2	6	182810	182815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_003552	T	6	6	182832	182837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_003552	A	6	6	182879	182884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_003552	TCG	2	6	182945	182950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_003552	CAA	2	6	182987	182992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_003552	TGG	2	6	183020	183025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_003552	T	6	6	183043	183048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_003552	CCTT	2	8	186108	186115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_003552	TTTC	2	8	186121	186128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_003552	T	6	6	186199	186204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1052	NC_003552	CAA	2	6	187928	187933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_003552	TGT	2	6	187953	187958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_003552	T	6	6	187958	187963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_003552	TA	3	6	187967	187972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_003552	ATT	2	6	187996	188001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_003552	T	7	7	188000	188006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_003552	AT	3	6	188007	188012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_003552	T	6	6	188016	188021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_003552	TTAT	2	8	188049	188056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_003552	A	6	6	188102	188107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_003552	A	7	7	188109	188115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_003552	A	6	6	188124	188129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_003552	AAAT	2	8	188184	188191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_003552	T	6	6	188973	188978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_003552	TA	4	8	189025	189032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_003552	ATT	2	6	189040	189045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_003552	AAGG	2	8	189556	189563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_003552	GGA	2	6	189577	189582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_003552	CTT	2	6	189644	189649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_003552	ATTT	2	8	190184	190191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_003552	ATC	2	6	190223	190228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_003552	ATGT	2	8	190270	190277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_003552	AAT	2	6	190312	190317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_003552	TGG	2	6	190344	190349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1084	NC_003552	TAA	2	6	193067	193072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_003552	AGG	2	6	193141	193146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_003552	GCTCA	2	10	194133	194142	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1088	NC_003552	TGC	2	6	194210	194215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1090	NC_003552	AAAT	2	8	194373	194380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_003552	AAT	2	6	194384	194389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_003552	GAG	2	6	194479	194484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_003552	TA	3	6	196451	196456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1096	NC_003552	TA	3	6	196591	196596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_003552	AAG	2	6	196619	196624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_003552	CGA	2	6	196645	196650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1105	NC_003552	ATT	2	6	196986	196991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_003552	TA	3	6	197009	197014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_003552	TA	4	8	197033	197040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_003552	A	6	6	197067	197072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_003552	TC	4	8	197080	197087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_003552	CGC	2	6	197090	197095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1112	NC_003552	CAT	2	6	197186	197191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_003552	TCTCT	2	10	197482	197491	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1114	NC_003552	T	6	6	197494	197499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_003552	A	7	7	197531	197537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_003552	TAA	2	6	197576	197581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1118	NC_003552	T	7	7	197687	197693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_003552	TC	3	6	197701	197706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_003552	CT	3	6	197717	197722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_003552	TCTT	2	8	197725	197732	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_003552	TTA	2	6	197760	197765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_003552	AT	3	6	197775	197780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_003552	GTT	2	6	197870	197875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_003552	T	6	6	197893	197898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_003552	T	6	6	197952	197957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_003552	TCT	2	6	197968	197973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_003552	T	7	7	197984	197990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_003552	TTTC	2	8	198007	198014	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_003552	T	6	6	198027	198032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_003552	AT	3	6	198079	198084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_003552	TAAAAT	2	12	198106	198117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_003552	TGAA	2	8	198185	198192	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_003552	TCT	2	6	198196	198201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_003552	A	6	6	198208	198213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_003552	TGA	2	6	200547	200552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_003552	GAA	2	6	200622	200627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_003552	AAT	2	6	200628	200633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_003552	A	6	6	200645	200650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_003552	ATT	2	6	200694	200699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_003552	ATT	2	6	200707	200712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_003552	G	6	6	200742	200747	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_003552	T	6	6	201815	201820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1146	NC_003552	T	7	7	203224	203230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_003552	T	6	6	203232	203237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1148	NC_003552	T	6	6	203387	203392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1151	NC_003552	AG	3	6	203487	203492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1155	NC_003552	A	7	7	204527	204533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1156	NC_003552	GCAG	2	8	204553	204560	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1165	NC_003552	TCT	2	6	207832	207837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1173	NC_003552	TAT	2	6	210177	210182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1176	NC_003552	AGC	2	6	210297	210302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1263	NC_003552	AT	3	6	231652	231657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_003552	TAT	2	6	231666	231671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_003552	AAC	2	6	231690	231695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1267	NC_003552	TAT	2	6	231772	231777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1272	NC_003552	ATTA	2	8	234822	234829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1273	NC_003552	ATA	2	6	234853	234858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_003552	CAT	2	6	234873	234878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1275	NC_003552	CAA	2	6	235073	235078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1276	NC_003552	T	7	7	235135	235141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1277	NC_003552	T	6	6	235144	235149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1279	NC_003552	T	7	7	235181	235187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1280	NC_003552	T	6	6	235201	235206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1413	NC_003552	AAGG	2	8	261036	261043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_003552	AAAG	2	8	261046	261053	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_003552	GCA	2	6	261072	261077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1418	NC_003552	TTG	2	6	262431	262436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_003552	T	7	7	262441	262447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_003552	ATT	2	6	262487	262492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_003552	ATT	2	6	262524	262529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_003552	TTA	2	6	262563	262568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_003552	TGT	2	6	262579	262584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_003552	ATT	2	6	262647	262652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_003552	TAC	2	6	262684	262689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1427	NC_003552	TGG	2	6	262721	262726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_003552	A	6	6	262845	262850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_003552	TAT	2	6	262880	262885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_003552	TCT	2	6	270162	270167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_003552	TAA	2	6	270192	270197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_003552	AAT	2	6	270217	270222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1447	NC_003552	CTTTTT	2	12	270862	270873	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1449	NC_003552	T	6	6	270910	270915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_003552	TTG	2	6	271047	271052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_003552	ATT	2	6	271077	271082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_003552	ATATTT	2	12	271101	271112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_003552	CTT	2	6	271118	271123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1454	NC_003552	TATT	2	8	271133	271140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_003552	T	6	6	271159	271164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_003552	ATA	2	6	271177	271182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1458	NC_003552	TAAA	2	8	271190	271197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1459	NC_003552	TTTA	2	8	271235	271242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1461	NC_003552	T	6	6	271273	271278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1462	NC_003552	TGT	2	6	271296	271301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1464	NC_003552	GGC	2	6	271363	271368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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